O sistema de registros vitais brasileiros do Ministério da Saúde com informações sobre mortalidade infantil (SIM) apresenta problemas de completude e inconsistência de dados que põem em questionamento sua confiabilidade no apoio ao planejamento e avaliação do impacto das ações públicas de atenção à saúde materno-infantil. Nos registros é possível observar tanto a causa básica de morte como as causas associadas à mesma. A análise da mortalidade infantil neonatal sob a ótica das causas que a determinam permitem ampliar o conhecimento dos fatores patológicos que envolvem o binômio mãe-filho desde a gravidez ao parto. Com uma população de mais de 4 milhões de habitantes no estado da Paraíba, região Nordeste, foram notificados entre 2009 e 2017, 5.149 óbitos infantis neonatais. A variável causa de óbito associada (linha B da Declaração de Óbito) possui cerca de 20% de missing-values, percentual preocupante já que não há técnicas definidas de como recuperar essas informações. Das causas básicas declaradas, em média 60% são de causas evitáveis, factíveis de prevenção. Teve-se como objetivo imputar as informações ausentes através de fatores de risco materno-infantil das causas associadas dos óbitos neonatais declarados no estado da Paraíba dos registros de 2009 a 2017. Foram utilizados os microdados das declarações de óbitos neonatais (SIM) e do Sistema de Informações de Nascidos Vivos (SINASC) dos 223 municípios do estado. As causas básicas e associadas foram agrupadas segundo os grupos da Lista Brasileira de Evitabilidade, ou seja, foi realizada a imputação do grupo de causas a que os óbitos pertencem. A completude foi obtida através da técnica de imputação múltipla, na qual foram observados os padrões monotônicos e o mecanismo completamente aleatório nos dados faltantes. As variáveis materno-infantis como raça/cor, escolaridade da mãe, tipo de gravidez, semanas de gestação, tipo de parto, idade da mãe e peso ao nascer apresentaram correlação significativa com a causa básica, sendo utilizadas como preditoras no processo da imputação das causas associadas, já que estas são fortemente correlacionadas com as causas básicas. Esta proposta metodológica se constituí em uma alternativa viável de replicação em qualquer região com deficiências dessas informações.