Ciertos contextos en territorios como: la inseguridad, el bajo interés en la participación públicas y las dinámicas irregulares de migración son factores potenciales al incremento de la omisión en el Censo Nacional de Población y Vivienda (CNPV), la cual puede sesgar algunos resultados de la operación, principalmente en territorios con una baja población residente. Ante esto, el Registro Estadístico Base de Población (REBP), los Registros Administrativos (RRAA) de potenciales beneficiarios a sistemas sociales y las encuestas a hogares por muestreo periódicas son un gran insumo para cumplir con una cobertura y calidad oportuna a la operación censal bajo los problemas en territorio que se presenten. La presente investigación muestra una estrategia metodológica donde la integración del censo con el REBP permite una cobertura adecuada, así como la integración de los RRAA y las encuestas por muestreo llegan a generar las características básicas de la potencial población omitida en esta operación censal. Adicional a la estrategia metodológica se presenta el análisis de concordancia entre los datos almacenados en estas fuentes alternas de información población con la recolectada de manera tradicional conociendo la pertinencia y el diagnóstico del ejercicio. Diversas investigaciones tipo censo en el archipiélago de San Andres, Providencia y Santa Catalina – Colombia, han presentado algunas particularidades en el territorio que impulsaron la construcción de la iniciativa donde el último CNPV reporto 48.299 personas censadas con una omisión del 21.2% y que permitió la implementación de la estrategia metodológica mencionada en el presente documento.