Colombia ha sido un país marcado por la violencia, siendo los homicidios la primera causa de muerte durante décadas, esto ha generado impactos negativos en toda la sociedad, especialmente en la población joven que se encuentra en edades productivas. El presente trabajo muestra la tendencia de la mortalidad por homicidios durante los últimos veinte años 1998-2017 a nivel municipal, a nivel urbano y rural, y teniendo en cuenta los mecanismos utilizados para el homicidio con base en la causa básica de muerte consignada en los registros de defunción del Departamento Administrativo Nacional de Estadística. Se estimaron las tasas estandarizadas de mortalidad teniendo en cuenta variables como el sexo, el área donde ocurrió la defunción, la edad, el municipio de ocurrencia de la defunción y residencia de la víctima. En el periodo de análisis se observó una importante disminución de la tasa de mortalidad en especial, a partir del año 2003, así mismo, se evidenció la magnitud de la sobremortalidad masculina por esta causa de muerte, siendo la zona rural la de mayor riesgo. En cuanto al mecanismo utilizado para perpetrar la muerte, el disparo de armas fue el que mostró mayores tasas de mortalidad, afectando en mayor medida a los hombres jóvenes. El análisis de la mortalidad a nivel municipal mostró como algunas zonas del país disminuyeron sus tasas de mortalidad en un periodo relativamente corto, entre ellas el norte, centro y sur oriente del país. Es necesario que la sobremortalidad masculina no opaque la mortalidad de las mujeres, la cual ha tenido pocas variaciones durante los últimos 20 años con excepción de algunos municipios al sur oriente del país. Colombia enfrenta grandes retos frente a los nuevos escenarios del posacuerdo, siendo clara la oportunidad para continuar disminuyendo las tasas de homicidio a pesar de la reconfiguración de los grupos armados y las transformaciones de la violencia luego de más de 50 años de conflicto. La reducción de la mortalidad por homicidios es sin duda una buena noticia, sin embargo, el estancamiento de los últimos cuatro años puede estar ocultando otros elementos frente al contexto histórico actual que vive el país.